在PHP中实现高效的数据库操作涉及多个方面，包括数据库设计、索引、SQL优化、PHP代码优化等。以下是一些最佳实践：

1. 使用PDO (PHP Data Objects) 或MySQLi 进行数据库操作：
这两个库提供了更安全、更灵活的数据库访问方式，支持 prepared statements，可以防止SQL注入攻击。

```php
// PDO Example
$pdo = new PDO('mysql:host=localhost;dbname=yourdb', 'username', 'password');
$stmt = $pdo->prepare('SELECT * FROM users WHERE id = :id');
$stmt->bindParam(':id', $id, PDO::PARAM_INT);
$stmt->execute();
```

2. 使用索引：
确保经常查询的字段都有索引。

3. 优化SQL语句：
- 避免使用SELECT *，而是明确指定需要的字段。
- 使用分析工具（如EXPLAIN）来分析SQL语句的执行计划。
- 避免使用子查询，如果必须使用，考虑将其转换为join。
- 使用limit和offset来分页查询。

4. 使用事务：
对于需要保证数据一致性的操作，使用事务可以提高操作的效率和可靠性。

5. 避免频繁的查询和数据重复：
- 尽量减少数据库查询次数，比如通过缓存或预加载数据。
- 避免在数据库中重复存储相同的数据，比如通过外键关联。

6. 使用数据库缓存：
使用数据库缓存可以显著提高重复查询的效率。可以使用Memcached、Redis或其他缓存系统。

7. 优化PHP代码：
- 避免使用循环进行数据库查询，而是使用join或子查询。
- 避免使用不必要的函数调用和计算。
- 使用对象和数组缓存来减少数据库的访问。

8. 使用数据库特有的功能：
- 利用MySQL的存储引擎特性，比如InnoDB和MyISAM的差异。
- 使用MySQL的`COM_PUSH`和`COM_PULL`来减少网络流量。

9. 监控和调整：
定期监控数据库的性能，使用性能分析工具如Percona Toolkit或MySQL Profiler来查找性能瓶颈。

10. 使用ORM（对象关系映射）工具：
ORM可以帮助简化数据库操作，但要注意避免使用不当导致性能下降。

```php
// Example with Laravel's Eloquent ORM
$user = User::find($id);
```

11. 确保数据库配置合理：
- 调整数据库的参数，比如innodb_buffer_pool_size、max_connections等。
- 使用读写分离和负载均衡来处理高并发。

通过结合以上最佳实践，你可以显著提高PHP应用程序中数据库操作的效率。记住，性能优化是一个迭代的过程，需要根据实际情况不断调整和优化。