重庆醋酸丁酯（CH3CH2CH2COOCH3）和醋酸乙酯（CH3COOCH2CH3）都是酯类有机化合物，它们在分子结构上有所不同，这些差异导致了它们在化学性质上的区别。

分子结构区别：
1. 链长不同：重庆醋酸丁酯含有4个碳原子（丁基），而醋酸乙酯含有3个碳原子（乙基）。
2. 连接方式不同：在重庆醋酸丁酯中，丁基与羧基（-COOH）相连，而在醋酸乙酯中，乙基与羧基相连。

化学性质区别：
1. 沸点不同：由于重庆醋酸丁酯的分子量较大（116.17 g/mol），其沸点通常高于醋酸乙酯（77.05 g/mol）。
2. 溶解性不同：重庆醋酸丁酯和醋酸乙酯都是有机溶剂，但它们的溶解性可能略有不同，这取决于具体的应用和环境条件。
3. 反应性不同：虽然重庆醋酸丁酯和醋酸乙酯都属于酯类，但它们可能会在某些化学反应中表现出不同的反应速率或产物分布，这取决于反应的条件和催化剂等因素。

需要注意的是，重庆醋酸丁酯和醋酸乙酯都属于挥发性有机化合物（VOCs），它们在工业上可能有不同的应用，例如作为溶剂、涂料、粘合剂等。由于它们的化学性质略有不同，因此在选择和使用时需要根据具体需求进行考虑。