南通模板小程序和定制小程序是两种不同的小程序开发方式，它们的主要区别如下：

1. 开发方式：
- 模板小程序：使用已经开发好的模板，用户只需进行简单的配置和个性化设置，如更换图片、文字等，即可快速生成一个小程序。
- 定制小程序：根据用户的具体需求，由开发团队量身定制开发，包括前端设计、后端开发、功能实现等。

2. 功能灵活性：
- 模板小程序：功能和界面布局受到模板限制，用户可自定义的空间有限。
- 定制小程序：可以根据用户的需求定制功能，灵活性高，能够满足个性化的业务需求。

3. 成本和时间：
- 模板小程序：成本较低，开发时间短，适合对功能要求不高，希望快速上线的项目。
- 定制小程序：成本较高，开发时间较长，适合对功能有较高要求，愿意为个性化体验和独特功能付费的项目。

4. 技术支持和服务：
- 模板小程序：通常提供基本的在线帮助文档和技术支持，可能无法提供个性化的技术服务。
- 定制小程序：开发团队会提供全程的技术支持和售后服务，确保小程序的稳定运行和功能优化。

选择指南：

- 功能需求：如果您的业务需求复杂，需要定制化的功能和界面，那么定制小程序是更好的选择。如果功能需求较为简单，模板小程序可能已经能够满足您的需求。

- 预算和时间限制：考虑您的预算和项目时间表。模板小程序通常成本较低，开发周期短，适合预算紧张和时间紧迫的项目。定制小程序则可能需要更多的预算和开发时间。

- 长期规划：考虑小程序的未来扩展性和维护需求。定制小程序通常更易于维护和升级，可以随着业务发展不断迭代和优化。

- 技术支持和维护：评估您对技术支持和维护的需求。定制小程序通常提供更全面的技术支持和服务，而模板小程序可能仅提供有限的支持。

总结来说，选择模板小程序还是定制小程序取决于您的具体需求、预算、时间限制以及长期规划。如果需要高度定制化和专业的技术支持，定制小程序可能是更好的选择；如果功能需求简单，且希望快速上线，模板小程序可能是一个经济高效的选择。